Alice in Chains
Le 18/02/2005, MJK rejoint Jerry Cantrell, Mike Inez et Sean Kinney sur scène, à Seattle lors d'un concert caritatif pour les victimes du tsunami qui a balayé l'Asie. Ils reprennent ainsi ensemble trois anciens titres du groupe : "Them Bones", "Man in the Box" et "Rooster". C'est aussi l'occasion de rendre hommage à Layne Staley, décédé en 2002, qui avait lui aussi rejoint Tool sur scène pour "Opiate".

animation 3D
Quand Adam Jones a découvert une animation réalisée en autodidacte par Chet Zar, il lui a alors aussitôt demandé si Tool pouvait l'utiliser. D’autres ont alors été envisagées, lesquelles seront projetées lors des concerts.
L'utilisation de la 3D ne fera par contre son apparition dans les vidéos de Tool qu'à partir de celle de "Parabola", pour le prologue et lors de la transformation finale ; la suivante, celle de "Vicarious", sera par contre entièrement conçue en utilisant cette technique.